[Forschungsseminar-BSV] Forschungsseminar Computergrafik, Bildverarbeitung und Visualisierung

[Steven Schlegel]

E I N L A D U N G

zum Forschungsseminar Computergrafik, Bildverarbeitung und 
Visualisierung am Mittwoch den 10. Oktober 2012, 13:15 Uhr, Raum P-701 
(Seminarraum II) im Paulinum am Augustusplatz.


Wir hören jeweils einen Vortrag von:

Sarah Seifert
Universität Leipzig

mit dem Titel

"Visualisierung von Chromatin-Daten mittels k-means++-Clustering und 
Starplots"


zum Inhalt:

Die Epigenetik zählt zu den neueren Gebieten der genetischen Forschung. 
Dabei werden Modifikationen von Histonen durch zum Beispiel 
Methylgruppen untersucht und ausgewertet. Auf Grundlage einer neuen 
Einteilung des Genoms in Segmente sollen die Veränderungen dieser 
Modifikationen in der Zellentwicklung erforscht werden. Dazu habe ich im 
Rahmen meiner Bachelorarbeit ein Framework erweitert, das das Clustern 
der Daten anhand bestimmter Einstellungen veranlasst und das Ergebnis 
anschließend als Starplots dargestellt. Im Rahmen meines Vortrags möchte 
ich die Verfahren und Ergebnisse kurz vorstellen.


und:

Sebastian Kiunke
Universität Leipzig

mit dem Titel

"Segmentierung von Aorta und Herzkammern auf 4D MRT-Bilddaten"


zum Inhalt:
4D Phasenkontrast MRT (4D MRT) ist ein bildgebendes Verfahren, das 
Bewegungen im lebenden Organismus detektieren kann. Die Segmentierung
blutführender Strukturen ermöglicht eine gezielte Analyse der 
Bewegungsinformationen, wodurch insbesondere Rückschlüsse über den 
Blutfluss gezogen werden können. Da die Morphologie in den 4D
MRT-Aufnahmen nur kontrastarm dargestellt wird, wurde zur Segmentierung 
ein deformierbares Modell gewählt, das nur auf den Flussinformationen 
basiert. Zur vierdimensionalen Segmentierung der Aorta wurde das 
deformierbare Modell um die zeitliche Dimension erweitert. Die 
vierdimensionale Segmentierung der Herzkammern erfolgte im Gegensatz 
durch ein sequentielles Verfahren. Aufgrund des dynamischen Innenleben
des Herzens, zeichneten sich in den Flussdaten keine klaren Abgrenzungen 
der Herzkammern ab, wodurch die Segmentierungsergebnisse nur teilweise 
plausibel erschienen. Für die Aorta konnten zufriedenstellende 
Ergebnisse erreicht werden.



Alle Interessierten sind im Namen von Prof. Dr. Scheuermann herzlich 
eingeladen.

Mit freundlichen Grüßen,
Steven Schlegel
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