[Forschungsseminar-BSV] Forschungsseminar Computergrafik, Bildverarbeitung und Visualisierung

[Tom Liebmann]

E I N L A D U N G

zum Forschungsseminar 'Computergrafik, Bildverarbeitung und Visualisierung'

     am Mittwoch, den 15. Juli 2015, 13:15 Uhr,
     Raum P-701 im Paulinum am Augustusplatz.


Wir hören zwei Vorträge von:

     Janis Micus
     Institut für Informatik
     Universität Leipzig


mit dem Titel

     "Eine interaktive, visuelle Unterstützung von referenzbasierten 
Genom-Assemblierungen"


zum Inhalt:

     Beim Sequenzieren von Genomen werden zunächst Teilsequenzen (reads)
     erzeugt. Da reads kurz sind und fehlerhaft sein können, wird ihre
     Assemblierung zu längeren Teilsequenzen uneindeutig, was die
     automatische Assemblierung erschwert.

     Die Bachelorarbeit, welche in diesem Vortrag vorgestellt wird, 
beschäftigt
     sich mit der interaktiven, visuellen Unterstützung dieser Aufgabe. Dem
     Nutzer wird es hierdurch ermöglicht, Unstimmigkeiten in der 
Assemblierung
     zu erkennen und die Zusammensetzung manuell nachträglich zu verändern.
     Hierzu wird eine homologe Sequenz (Sequenz mit hoher 
Übereinstimmung) als
     Referenz genutzt, um lokale Alignments zwischen den beiden Sequenzen zu
     generieren. Der Schwerpunkt der Bachelorarbeit liegt darin, dem 
Nutzer die
     zugrundeliegenden Daten visuell aufzubereiten und ihn bei der
     Zusammestellung der Sequenz zu unterstützen.



und von:

     Dr. Dirk Zeckzer
     Abteilung für Bild- und Signalverarbeitung
     Institut für Informatik
     Universität Leipzig


mit dem Titel

     "A Multi-Replicate Peak Caller"


zum Inhalt:

     Einleitend werde ich eine Übersicht über den Prozess von der
     Genom-Sequenzierung bis zur Visualisierung von Chromatin-Daten 
geben. Der
     Fokus des Vortrages wird dann auf der Vorstellung eines neuartigen Peak
     Callers für mehrere Replikate einer solchen Genom-Sequenzierung liegen.
     Neben der eigentlichen Berechnung spielt hierbei die visuelle 
Unterstützung
     der Qualitätskontrolle der Replikate eine wesentliche Rolle.



Alle Interessierten sind im Namen von Professor Dr. Scheuermann herzlich 
eingeladen.

Mit freundlichen Grüßen,
Tom Liebmann