[Forschungsseminar-BSV] Forschungsseminar Computergrafik, Bildverarbeitung und Visualisierung
Vanessa Kretzschmar
kretzschmar at informatik.uni-leipzig.de
Mi Jun 21 13:05:30 CEST 2023
Achtung:
- anderer Raum
E I N L A D U N G
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zum Forschungsseminar 'Computergrafik, Bildverarbeitung und Visualisierung'
am Mittwoch, den 28. Juni 2023, 13:15 Uhr,
im Raum P-701, Paulinum, Augustusplatz 10, 04109 Leipzig, sowie
über eine Webkonferenz.
(https://conf.fmi.uni-leipzig.de/b/van-bwb-jil-vk2)
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Wir hören einen Vortrag von
Paul Glaß
mit dem Titel:
'GPU-Beschleunigtes Echtzeitrendering von Moleküloberflächen
mittels Distanzfunktion'
zum Inhalt:
Für die Darstellung und Visualisierung von Molekülen gibt es mehrere
Möglichkeiten basierend auf dem Fokus, den eine gewisse Darstellung
haben
soll. Besonders in der Analyse von Proteinen auf gewisse Eigenschaften,
die aus der Form resultieren wie Hydrophobizität und Faltung, ist die
Wechselwirkung mit Lösungsmitteln essenziell. Das Ziel der vorliegenden
Arbeit ist die Entwicklung und Implementierung eines Proof of Concept
für die GPU-beschleunigte Erzeugung und Darstellung von sogenannten
Solvent Excluded Surfaces von Molekülen. Dazu wird die Verwendung von
OpenGL für die Generierung eines 3D-Distanzfeldes erläutert, durch
welche
das in dieser Arbeit genutzte Raymarching-Verfahren beschleunigt wird.
Um eine solche Darstellung zu erstellen wurde ein Python-Programm mit
OpenGL entwickelt, das Moleküldaten von der US-Amerikanischen Webseite
PubChem verarbeitet und sie in einer interaktiven Anwendung
visualisiert,
welche nach einem einmaligen Berechnungsaufwand eine interaktives Bild
mit hoher Bildrate erzeugen kann. Mit diesem Konzept wurde
demonstriert,
dass das Nutzen von Compute-Shadern zur einmaligen Vorberechnung von
3D-Distanzfeldern den Rechenaufwand reduzieren kann und eine
Echtzeitdarstellung
auch für große Moleküle ermöglichen kann.
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Alle Interessierten sind im Namen von Professor Dr. Scheuermann herzlich
eingeladen.
Mit freundlichen Grüßen
Vanessa Kretzschmar
-------------- nächster Teil --------------
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